پلیس پیشگیری بزرگترین فرماندهی در ناجا است که مستقیماً فرماندهی کلیه کلانتری‌ها و پاسگاه‌های انتظامی سراسر کشور، پلیس فرودگاه‌های کشور، پلیس راه‌آهن، پلیس خدمات قضایی مستقر در سازمانها و وزارتخانه‌ها، یگان‌های امداد شهرستانها، یگان‌های حفاظت سازمانهای صداوسیما، و تعزیرات حکومتی، میراث فرهنگی و گردشگری، سازمان انرژی اتمی، حفاظت از محیط زیست، جنگلبانی و منابع طبیعی را عهده‌دار مباشد.
در حال حاضر فرماندهی و ریاست پلیس پیشگیری ناجا بر عهدهٔ سردار سرتیپ دوم پاسدار محمّد شرفی می‌باشد.
بخش‌ها و رده‌ها
- فرماندهی پلیس پیشگیری استان ها
- یگان حفاظت آستان قدس رضوی
- یگان حفاظت سازمان امور اراضی کشور
- یگان حفاظت منابع طبیعی سازمان جنگل ها، مراتع و آبخیزداری کشور
- یگان حفاظت سازمان حفاظت از محیط زیست
- یگان حفاظت سازمان میراث فرهنگی و گردشگری
- یگان حفاظت سازمان زندان ها و اقدامات تامینی و تربیتی کشور
- یگان حفاظت سازمان شیلات کشور
- یگان حفاظت سازمان انرژی اتمی
- یگان حفاظت سازمان صدا و سیما
- پلیس فرودگاه های کشور
- پلیس راه‌آهن
- یگان حفاظت سازمان بنادرودریانوردی
- یگان حفاظت سازمان تعزیرات حکومتی
- پلیس حفاظت از شخصیتها
- یگان امداد(نیروی ویژه بزرگترین فرماندهی و پلیس ناجا)
- پلیس خدمات قضایی ادارات و سازمانها
